Ce ne sont pas les sites sur R qui manquent. Une petite sélection tout à fait arbitraire & personnelle.
Avant tout, GRRR, la page SLACK de la communauté R francophone. Voir aussi la page sur les documents disponibles sur le web. "[**R*]" n’est pas un mot-clef bien pratique pour les moteurs de recherche. Vous pouvez essayer "Rstats" mais depuis peu il existe un moteur de recherche dédié à R : Rseek.

**Francophone

R-atique pédagogique mais néanmoins pointu.
Statistiques & logiciel R ou comment faire croire que R est simple.
Très complet, la page d’un cours de M2 sur la programmation avec R. les cours & de nombreux liens, bibliographie etc. (il y a un foyer de R sur l’université lyonnaise ?)
duclert.org Une bonne mine de fonctions de base bien expliquées en quelques lignes avec des exemples.
ABCD’R Des manips de base, très simples mais utiles/ Pour les débutants (mais si vous n’êtes pas débutant vous n’avez rien à faire ici) STHDA Des tutos très bien faits, simples & clairs en particulier sur ggplot2 (parfois en anglais)
Un petit peu de R tous les matins sur Twitter.

**Dans la langue de John Lennon

statmethods.net. Peu de sujets abordés mais à chaque fois bien fouillé.
Inside R Toutes les descriptions de fonction, bien présentées et un blog, des how-to etc.
R-bloggers : ça part dans tous les sens, des tutos, de l’anecdote mais toujours intéressant.
Revolution : Fouillis mais des tutos bien faits de tous niveaux y compris débutant.
Du lourd : le Journal of Statistical Software

Knitr

Le site : des exemples, des explications mais pas toujours très clair. Tout y est, à vous de le trouver.