Généralités techniques

Un collègue vient de vous envoyer ses données à traiter sous forme d’un tableur. bien entendu ces données ne sont pas exploitables tel quelles. Que faire pour ne pas trop se prendre la tête et aller vite ?
Ci dessous le document que je remets à mes collègues qui vont stocker leurs données dans un tableur.
Avant tout, allez voir quelques conseils indispensables. Ensuite comment préparer ses données. À exiger Le donneur d’ordre doit vous fournir un travail correct pour que vous puissiez travailler à (...)

Un nouveau projet, un nouveau dossier. Et dans ce dossier des sous-dossiers , toujours les mêmes. Autant automatiser la création de tout ça.
Ce sont les flemmards qui font avancer le monde & dans ce domaine j’ai des compétences !
Donc un nouveau projet (voir mes conseils), un nouveau dossier. Et dans ce dossier au minimum : un fichier [**Rmarkdown*] un fichier de biblio "stat" un fichier d’entête [*.tex*] pour avoir une belle sortie en pdf des sous dossiers : - Graph - Doc - R (...)

Les données qu’on vous confie sont TOUJOURS mal ficelées, avec des aberrations dans la présentation, du texte dans les données numériques etc. Voici quelques conseils en vrac (enfin à peu prêt dans l’ordre où vous allez en avoir besoin) pour gagner du temps ensuite. Cela va sans dire mais ça fait toujours du bien de le rappeler : faites des sauvegardes. De tout. Tout le temps. Sur plusieurs supports. Pour les thésards qui remplissent leur tableau Excel : lisez bien la première partie de l’article, ça (...)

Un peu de hardware même si au final ça a très peu d’importance. Pour utiliser ces deux excellents logiciels, il faut du matériel de pointe enfin presque. [*LaTeX*] et [*R*] ont en commun d’être des logiciels en mode texte. En étant vraiment intégriste, on peut les utiliser en mode texte pur et dur dans une console. Bon d’accord c’est complètement inconfortable. Mais même l’éditeur de texte le plus élégant avec de la couleur et des icônes partout demande moins de ressources graphiques que le premier jeu (...)

La guerre R contre LaTeX est déclarée dans le monde de la diapo.
RMarkdown + xaringan ou LaTeX + Beamer ?
"I fall asleep when I see beamer slides" dixit Yihui Xie, le créateur de knitr & xaringan (entre autres). Désolé mais je ne suis pas encore tout à fait d’accord.
Je vais être franc, je n’utilise quasiment plus LaTeX pour mes travaux. Comme je rends principalement des rapports contenant des statistiques l’usage de RMarkdown est beaucoup plus simple que du $\LaTeX$ avec knitr. Les quelques (...)

Vous réouvrez un travail réalisé il y a quelques semaines, vous refaites un calcul & ne trouvez plus le même résultat. Une situation qui peut paraître bizarre mais qui demeure très fréquente. Où on vous signale une erreur, mais où ? Comment la retrouver sans refaire tout le travail ? Pour en finir avec l’introduction chaque langage a des outils adaptés, je ne parlerai ici que de R & de LaTeX, bien entendu.
Tout travail scientifique doit pouvoir être reproduit. c’est une base. Dans un article (...)

Plus que de simples conseils, des règles à ne surtout pas transgresser (sauf quand c’est nécessaire). Voir aussi la page sur comment commencer un travail. Un travail, un dossier [**R*] comme tout logiciel va s’ouvrir par défaut toujours dans le même répertoire. Erreur, c’est un coup à avoir des données dans tous les sens ou de commencer chaque session en effaçant tout . Un travail, un répertoire. Avec les données brutes (les tableaux en .csv par ex), les graphiques & autres sorties (dans des (...)

Même en statistiques il y a des traditions difficiles à contourner. Et malgré l’abandon des cartes perforées depuis déjà quelques années les statisticiens (les vrais, pas moi) continuent à tout coder en numérique. **Thèse Dans tous les cours ou TP de statistiques que j’ai suivi on notait des "oui" ou "succès" par 1 et le "non" ou "échec" par 0. Jusque là, pourquoi pas. Mais quand on note les hommes par "1" et les femmes par "0" ou l’inverse, expliquez-moi la logique et comment je vais m’y retrouver. Bien (...)

Ce ne sont pas les sites sur R qui manquent. Une petite sélection tout à fait arbitraire & personnelle. Avant tout, GRRR, la page SLACK de la communauté R francophone. Voir aussi la page sur les documents disponibles sur le web. "[**R*]" n’est pas un mot-clef bien pratique pour les moteurs de recherche. Vous pouvez essayer "Rstats" mais depuis peu il existe un moteur de recherche dédié à R : Rseek. **Francophone R-atique pédagogique mais néanmoins pointu. Statistiques & logiciel R ou (...)

Un bon éditeur fait tout le travail ou presque mais pour certaines taches un programme dédié est bien pratique. Les logiciels cités ici existent le plus souvent pour plusieurs plates-formes. Gestionnaire de version Même pour travailler tout seul un gestionnaire de version s’impose. Dés que le projet devient un peu complexe, concerne plusieurs documents et traîne sur plusieurs mois il faut savoir où on en est et pouvoir revenir en arrière au besoin. La gymnastique est un peu difficile à comprendre au (...)